進一步分析植物園的分區，從園區西南角的主入口進入，可直達植物研究所主樓，其背后是一片疏林草地，它的周圍是苗圃，期間散落布置著一些宿舍樓。繼續往東是高山植物區和地帶性植物分布區，其北側是面積較大的溫室區，植物園博物館緊鄰溫室，沿街設置。整個園區再往東，是面積較大的樹木園區，也是植物園內精致最優美的區域。辦公區設置在樹木園北側，與博物館相鄰。整個樹木園區中央部分是一處面積不大的水景設施。營建之初就明確了科研目的，園林設計簡單、緊湊而實用，樹木園的中心和西部采用自然風景式設計，東部則是規則式圖案布局，園中貫穿著林蔭道和小路。