2004年至2009年，上海植物新品種申請量從年5件增加到23件，從數量上增長了4.6倍。2005年4月，上海科教興農網開設“農業植物新品種保護”專欄，2009年進一步豐富內容，對植物新品種權申請辦法、上海市植物新品種權授權公告等進行宣傳，在植物新品種領域取得了較大進展。2009年，上海新增植物新品種權申請數量23個，包括水稻、玉米等大田作物與西甜瓜、桃、花卉等經濟作物。目前，上海市科技興農重點攻關項目已進行知識產權查新354次。2008年上海市農業科技攻關驗收項目中共有2個新品種權保護申請、5個專利發明申請、2個實用新型專利申請。上海市農科院有32個農業新技術（或新配方）申請了發明專利，水稻、玉米、花菜、番茄和桃等種屬的9個新品種申請了植物新品種權，授權發明專利4件

　　2004年至2009年，上海已申請植物新品種權保護且初審合格的新品種數量達到58件。其中，“花30”、“花22”等系列細胞工程啤酒大麥品種在全國中指1000萬畝，帶動農民增收2億元；“滬油雜1號”成為我國自主培育的第一個高抗油菜病毒病和菌核病的雜交雙低油菜，在雜交油菜顯性、隱性核不育性研究上處于世界領先水平。“申粉8號”番茄占全國市場份額30%，東方蜜哈密瓜在本地市場份額已達50%。此外，上海目前已有青浦練塘茭白、崇明老白酒等5個農產品獲得國家地理標志保護，43個獲得上海市名牌（農產品）稱號，46個被授予上海市著名商標。據不完全統計，“甘藍型油菜隱性核不育純合型不育株的無性擴繁及全不育系生產技術”等97個農業新技術（或新配方）申請了發明專利；“浮板基質省力化栽培盒”等6個申請了實用新型專利。