一、在生長中后期球莖及莖生根處易感染根腐病，呈明亮暗褐色爛斑。在植株莖基易發生基腐病，使葉下垂變黃；在葉上還會感染葉斑病，使植株停止生長。鱗莖及鱗片腐爛病，在地下莖呈褐色至黑褐色斑點，逐漸擴大到莖內部，使鱗莖腐爛。還有一種立枯病，病株幼葉出現黃綠或白色斑點，嚴重葉變為褐色，葉片出現卷曲。

　　防治：立枯病是一種生理性病害，其它病害均由真菌引起，可用50%多菌靈，每畝1千克進行灌根，或與50%的代森銨100倍液混合使用。注意發病初期應立即拔除病株，并立即防治。

　　二、百合無癥病毒，又稱百合病毒或“百合曲條病毒”。

　　（1）癥狀：一般情況無癥狀，或葉上產生輕度斑暈，皺曲條紋。容易形成復合感染，為與CMV復合感染時產生壞死斑點，與郁金香碎色病毒復方感染時產生褐色壞斑或條斑。

　　（2）分布：我國江南、江北各地均有發生，尤以廈門為嚴重。

　　（3）病原：病毒質粒為線條狀，長而稍帶彎曲，長度為650nm，直徑為18nm。汁液傳播和蚜蟲傳播。麝香百合作為診斷寄主。市場上出售的百合鱗莖中普遍帶毒。

　　（4）防治：選擇無病毒鱗莖作為種源。加強防治蚜蟲工作。百合無癥病毒也能為害郁金香，因此這兩種花卉不能混種、套種或連作。

　　百合的種子壽命極短，貯存半年后就會失去發芽力，且播種實生苗需培養多年才能開花。因此都采用扦插繁殖，吧老鱗莖的鱗片分掰下來，每個鱗片的莖部應帶有一小部分莖基盤，埋入純凈的細沙或泥漿中，讓鱗片的上半部分露出土面，放在室內或蔭棚內養護，3個月到4個月后可長出1枚至2枚小鱗莖，將它們分掰下來栽入苗床繼續培養，春季上盆，栽培3年以后就能開花。

　　百合種球采挖后，為實現周年開花，必須進行低溫處理和貯藏。先在15攝氏度下，保持4天到5天，然后將溫度降至9攝氏度，保持3周，再降低至0攝氏度到5攝氏度保持8周，即完成低溫春化處理階段，可進入-2攝氏度的長期貯藏。但在貯藏之前須進行分級清洗、消毒、包裝等。采挖后把大小種球分開。對已經發芽或長新根的小種球，可立即栽培；對已長新根的大種球進行低溫貯藏。